Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
GAPVD1Q14C86 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms