Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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