Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AP004247.4-201ENST00000608484 942 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TRAF6P1-201ENST00000429404 1558 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC023154.1-203ENST00000508813 2465 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC008708.2-201ENST00000522956 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PPARGC1A-206ENST00000507380 2385 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 COL25A1-208ENST00000610288 4799 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC024610.2-203ENST00000636084 1348 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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