Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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