Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FSCN1Q16658 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms