Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
GRIK4Q16099 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms