Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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