Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
CDH18Q13634 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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CDH18Q13634 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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