Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PTP4A2Q12974 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PTP4A2Q12974 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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PTP4A2Q12974 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PTP4A2Q12974 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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