Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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