Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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ITGB4P16144 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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ITGB4P16144 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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ITGB4P16144 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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ITGB4P16144 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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ITGB4P16144 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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ITGB4P16144 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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ITGB4P16144 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
ITGB4P16144 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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