Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CCDC142Q17RM4 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CCDC142Q17RM4 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC142Q17RM4 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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