Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 UBQLNL-201ENST00000380184 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CLEC7A-208ENST00000525605 573 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02059-202ENST00000506471 2094 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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