Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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SYCP1Q15431 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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SYCP1Q15431 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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SYCP1Q15431 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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SYCP1Q15431 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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SYCP1Q15431 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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SYCP1Q15431 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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SYCP1Q15431 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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