Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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TCOF1Q13428 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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TCOF1Q13428 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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TCOF1Q13428 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC9□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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TCOF1Q13428 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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TCOF1Q13428 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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TCOF1Q13428 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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