Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXF1Q12946 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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