Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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