Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BOD1P1-201ENST00000584421 436 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC036176.2-201ENST00000589763 1153 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 FXYD5-211ENST00000590686 862 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC135048.3-201ENST00000614997 328 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 LINC00595-209ENST00000634389 549 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 FPR3-202ENST00000595991 2222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 B4GALNT2-203ENST00000504681 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 WBP11P1-202ENST00000567636 2972 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 MTIF2-204ENST00000403721 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 COL4A4-201ENST00000396625 9895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CACNB1Q02641 FGG-203ENST00000404648 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ZNF443-201ENST00000301547 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 KCNT2-201ENST00000294725 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ITIH5-202ENST00000397146 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TCTN3-203ENST00000371217 2514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 KCNK2-201ENST00000391894 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNF141-201ENST00000265981 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CLDN18-201ENST00000183605 3520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 C4orf46-201ENST00000379205 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LILRB4-204ENST00000391736 4002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LINC01531-202ENST00000536898 3312 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TAC4-202ENST00000334568 675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SNORA68B-201ENST00000364518 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TRBV11-1-201ENST00000390367 364 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SNHG14-204ENST00000441592 608 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 IGKV1-6-201ENST00000464162 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RN7SL461P-201ENST00000484915 282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL133368.1-201ENST00000486273 814 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 IGKV1-9-201ENST00000493819 409 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 IGKV1-5-201ENST00000496168 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PRSS2-201ENST00000539842 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MIR4274-201ENST00000579577 91 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 KCNH6-205ENST00000583023 3821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 VDAC3P1-201ENST00000604654 850 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MIR7850-201ENST00000618087 79 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC000041.2-201ENST00000619824 151 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CCDC33-203ENST00000398814 2787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PFKFB1-202ENST00000375006 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LINC00598-214ENST00000637523 1943 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RPL23AP7-202ENST00000416673 2078 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ZC4H2-201ENST00000337990 2363 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 C11orf57-202ENST00000393047 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LRRC52-201ENST00000294818 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC005077.4-201ENST00000421546 3495 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 NCAM1-213ENST00000531044 2826 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 STAT1-204ENST00000409465 3097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 KLHL7-AS1-201ENST00000419813 2564 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CHMP2B-203ENST00000471660 2528 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms