Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
ERVV-1B6SEH8 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ERVV-1B6SEH8 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms