Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC85BQ15834 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC85BQ15834 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC85BQ15834 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KRTAP3-3-201ENST00000391586 704 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC85BQ15834 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC85BQ15834 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC85BQ15834 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CCDC85BQ15834 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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