Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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COL4A6Q14031 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
COL4A6Q14031 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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