Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PIK3CBP42338 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms