Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC096642.1-201ENST00000612055 2614 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 ATP2B2-201ENST00000352432 8593 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 LAMA3-207ENST00000587184 5007 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC105429.1-201ENST00000612833 4001 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC004947.1-202ENST00000457000 576 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AC002401.3-201ENST00000620020 440 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 MYO6-204ENST00000369985 8575 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 AP003038.1-201ENST00000527289 1754 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRHP20396 PPP2R5C-202ENST00000334743 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRHP20396 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRHP20396 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRHP20396 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRHP20396 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRHP20396 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 THUMPD3-201ENST00000345094 3961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC010547.5-201ENST00000561908 3677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 DCLRE1C-203ENST00000378242 1933 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 RPL15P1-201ENST00000439981 600 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRHP20396 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms