Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF337-AS1-206ENST00000455791 650 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RN7SL155P-201ENST00000581538 263 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC010320.1-201ENST00000599775 578 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC124944.3-204ENST00000641191 150 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms