Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U3KQK5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U3KQK5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U3KQK5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQK5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQK5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQK5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U3KQK5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U3KQK5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms