Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETBP1Q9Y6X0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms