Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA3Q9Y6Q9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms