Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD2APQ9Y5K6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD2APQ9Y5K6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms