Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TRRAPQ9Y4A5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRRAPQ9Y4A5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms