Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2J1Q9Y385 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms