Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF3AQ9Y2N7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms