Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATF5Q9Y2D1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATF5Q9Y2D1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms