Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC4Q9Y296 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC4Q9Y296 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms