Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUDCQ9Y266 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUDCQ9Y266 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUDCQ9Y266 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUDCQ9Y266 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUDCQ9Y266 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUDCQ9Y266 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUDCQ9Y266 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms