Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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