Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAK1Q9UPV9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms