Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTF2Q9UNY4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTF2Q9UNY4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms