Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPCN1Q9ULQ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPCN1Q9ULQ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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