Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA3Q9UL41 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms