Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYH13Q9UKX3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYH13Q9UKX3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms