Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL1Q9UK58 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL1Q9UK58 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms