Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD3Q9UJU5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms