Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPUSD1Q9UJJ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms