Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA1Q9UIW2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA1Q9UIW2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms