Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KDM5BQ9UGL1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KDM5BQ9UGL1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms