Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms