Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DKK3Q9UBP4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DKK3Q9UBP4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms