Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC6Q9UBN7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms