Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CABP1Q9NZU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CABP1Q9NZU7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms