Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR7Q9NYK1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR7Q9NYK1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms